Церковь Исидора Блаженного на валах также именуется как церковь Вознесения. Первое название храм получил по месту своего расположения: церковь построена на месте погребения блаженного Исидора, в ней же под спудом покоятся его святые мощи.

С давних времен в церкви существовала каменная плита с храмозданной надписью, в которой говорилось, что церковь построена в 1566 г. повелением царя Иоанна Грозного при архиепископе Никаноре Ростовском. В надписи упоминалось и имя зодчего - Андрей Малой.

Церковь не раз перестраивалась. В 1786 г. к южной стене храма был пристроен теплый придел св. Исидора Блаженного. Была изменена форма покрытия церкви, сооружена луковичная глава, растесаны окна. В XIX в. пристроили западную паперть и вместо прежней шатровой колокольни выстроили новую в классицистических формах, существующую по сей день.

Первоначальные формы храма были восстановлены при реставрации в 1956 - 1959 гг. архитектором Л.А. Давидом: в ходе работ был разобран южный придел, реконструированы шлемовидная глава, трехлопастное покрытие церкви, формы окон, профили цоколя и порталов.

По своей архитектуре церковь имеет много общего с московскими посадскими храмами того времени. Это бесстолпный храм, перекрытый крестчатым сводом. Наружные стены разделены лопатками на три части и имеют "трёхлопастное" завершение. Отсюда необычное, волнообразное покрытие храма.

Первоначальный интерьер церкви не был расписан. Стенопись появилась, как предполагают, в 1720-е гг. и после этого неоднократно обновлялась. При создании росписи был разобран древний четырехъярусный иконостас, вклад Иоанна Грозного, и восточная стена получила оформление по образцу церквей Архиерейского дома - на ней стенным письмом был написан иконостас традиционного состава.

В 2002 г. настоятелем храма назначен священник Олег Ельцов, здесь возобновились богослужения в воскресные и праздничные дни. Каждую субботу в 11 часов проводятся молебны блаженному Исидору с водосвятием.

Храм Вознесения - один из древнейших в Ростове. При возведении валов - оборонных сооружений - церковь бережно сохранили, окружив насыпью. Поэтому в своем названии она и получила приставку в валах. Внутри церкви имеется доска, на которой написано: "церковь эта поставлена по велению Иоанна Грозного на средства государевой казны в 1556 году, а строил ее мастер Андрей Малой".

Есть мнение, что и Богоявленский собор в Аврамиевском монастыре возведен этим талантливым зодчим. Каменный храм возведен на месте деревянного. По преданию, Грозный казнил архитектора за то, что тот не сохранил прежние размеры, уменьшив церковь.